Vanderbilt University geführten Forschungsteam hat Protein "Signaturen" genetische Mutationen, die fahren von Darmkrebs, die Nation zweite führende Todesursache bei Krebserkrankungen nach Lungenkrebs identifiziert.

Die technologische Tour De Force, in der aktuellen Ausgabe der Zeitschrift Nature beschrieben wird, als die ersten integrierten "Proteogenomic"-Charakterisierung der menschlichen Krebs, "neue Fortschritte ermöglichen werden" bei der Diagnose und Behandlung der Krankheit, schloss die Wissenschaftler.

"Es ist ein First of its Kind-Papier. Ich denke, es ist ein sehr bedeutender Fortschritt auf dem Gebiet", sagt senior Autor Daniel Liebler, Ph.d., Ingram Cancer Research Professor und Direktor des Instituts Ayers Jim für Precancer Erkennung und Diagnose am Vanderbilt-Ingram Cancer Center.

Das Forschungsteam, Vanderbilt und sechs andere Organe ist Teil von der Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC), gesponsert von der National Cancer Institute des nationalen Institutes der Gesundheit (NIH).

Proteomics ist die Studie der Proteine. Während viele genetische Mutationen, die mit Krebs verbunden identifiziert wurden, war es schwieriger zu analysieren, die Struktur und Funktion von Proteinen, die tatsächlich Krebs die "Arbeit". Bis jetzt.

Die Forscher verwendet erweiterte Massenspektrometrie Techniken zum Sammeln, Proteomic Daten 95 menschlichen colorectal Tumors Proben zuvor, geprägt von The Cancer Genome Atlas, ein staatlich finanziertes Projekt identifizieren genetische Anomalien in Krebs.

Datenanalyse führte Erstautor Bing Zhang, Ph.d., Associate Professor für biomedizinische Informatik. "Integration der Proteomik Daten mit der riesigen Menge von bereits vorhandenen Genomische Daten ist eine schwierige Aufgabe," Zhang "gilt jedoch es auch der Schlüssel für die Daten in neue Einblicke zu verwandeln."

Es ist ein biologisches Grundprinzip, dass DNA – den genetischen Code – "" in RNA transkribiert, dann "" in Proteine übersetzt. Dennoch fanden die Forscher, dass Anomalien in den Genen oder sogar die RNA der Proben nicht unbedingt "in abnorme Proteine übersetzen".

Ebenso einige Abschnitte der Chromosomen, das in den Tumor Proben "verstärkt" waren nicht zu verstärkten oder erhöhte Protein-Ebene führen.

Die habe, ergab sich jedoch, die "auffällige Effekte", was darauf hindeutet, dass Proteomics helfen könnte, identifizieren und priorisieren die meisten "wirkungsvoll" genetische Anomalien, die Ziele für die neue diagnostische Tests oder medikamentöse Behandlungen, sein könnte, sagte Liebler.

Die Forscher entdeckten auch fünf Subtypen des Darmkrebses, die auf der Grundlage ihres Eiweißgehalts, eines davon mit schlechten Ergebnissen verbunden war. Proteomics kann also helfen, Patienten zu identifizieren, die am meisten von einer Chemotherapie nach der Operation profitieren würde.

"Unsere Entdeckung von Proteomic Untertypen öffnet die Tür zu Protein-basierte Diagnostik, die potenziell die schlechten Krebserkrankungen identifizieren konnte, die die aggressive Therapie benötigen", sagte Liebler. "Das ist, was wir wirklich heiß auf Zukunft."

Liebler sagte, dass die Unterstützung des Instituts Ayers, wurde im Jahr 2005 mit einem $ 10 Millionen-Geschenk von Jim Ayers, Vorsitzender des FirstBank in Lexington, Tennessee, und seine Frau Janet Ayers, entscheidend für den Aufbau der Infrastruktur für die Durchführung der Forschung.

"Ohne das Ayers-Institut, wir würden nicht gewesen in der Lage sind, gelten auch für das CPTAC-Programm, ein Teil davon sein," sagte Liebler.

"Das spannende Neuigkeiten, die angezeigt wird, haben enorme Auswirkungen auf die Krebsdiagnose und Behandlung," sagte Janet Ayers. "Jim und ich erweitern unsere Glückwünsche an Dr. Liebler und das Team arbeitet mit dem Jim Ayers Institut für Precancer Erkennung und Diagnose am Vanderbilt-Ingram Cancer Center.

"Das sind die Arten von Entdeckungen, die wir erhofft, wenn das Institut vor ein paar Jahren ins Leben gerufen wurde," sagte sie. "Um zu starten, sehen Ergebnisse wie folgt so schnell ist äußerst lohnend."

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