Od ostatniej epoki lodowcowej, głęboko w jaskini spało coś horrendalnego, co przypadkowo zbudzili mali chłopcy. Ich odkrycie zwróciło uwagę tajemniczej grupy ludzi, zwanej Syndykatem.W pobliskim Dallas, agenci FBI; Dana Scully i Fox Mulder, ratują życie setkom ludzi, zagrożonych wybuchem bomby, podłożonej przez anonimowego terrorystę w gmachu władz federalnych. Niemniej, po eksplozji rząd próbuje obarczyć ich winą za śmierć kilku osób.Dlaczego ? W poszukiwaniu odpowiedzi na to pytanie, Mulder i S..cully przemierzają kraj, by potwierdzić swoje podejrzenia o istnieniu światowego spisku. Kiedy Scully zostaje uprowadzona i zainfekowana pozaziemskim wirusem, Mulder ma zaledwie kilkadziesiąt godzin na odnalezienie partnerki i podanie jej antidotum - zanim będzie za późno dla nas wszystkich. Czy jeden człowiek zdoła stawić czoła przyszłości ?